Во время начавшейся в 1937 году японо-китайской войны выявилось, что 7,92-мм винтовки системы Маузера и 7,62-мм винтовки системы Мосина, которыми была вооружена китайская пехота, превосходят по мощи огня японские винтовки «Арисака» обр. 38 калибром 6,5 мм. В связи с этим на базе винтовки «Арисака» обр. 38 была срочно разработана новая винтовка под пулеметный патрон М92 (7,7х58 мм).
Винтовка прошла испытания в 1938 году и была принята на вооружение японской армии под обозначением «7,7-мм винтовка «Арисака» обр. 99».
Как и предыдущие образцы винтовок «Арисака», винтовка обр. 99 является магазинной винтовкой со скользящим затвором с поворотом при запирании. В соответствии с требованиями военных в конструкцию винтовки внесены следующие изменения:

— ствол, затвор и магазинная коробка переделаны под патрон калибром 7,7 мм;
— уменьшены длина винтовки и ее вес;
— для повышения устойчивости винтовки при стрельбе под стволом закреплена откидывающаяся в походном положении вперед легкая сошка;
— введен новый прицел, позволяющий вести огонь по воздушным целям.

Винтовка «Арисака» обр. 99 выпускалась в двух основных вариантах: длинная винтовка для пехоты и укороченная на 55 мм винтовка для кавалерии, артиллерии и других специальных войск. Во время второй мировой войны выпуск длинной винтовки непрерывно снижался в пользу укороченной винтовки, которая стала единым оружием для всех родов войск.
На базе винтовки обр. 99 были созданы также складывающаяся винтовка для воздушно-десантных войск, снайперская винтовка с оптическим прицелом четырехкратного увеличения, а также предельно упрощенная так называемая «эрзац-винтовка», выпуском которой в последний месяцы войны японское командование стремилось покрыть нехватку стрелкового оружия.
Точные сведения относительно количества выпущенных винтовок «Арисака» обр. 99 отсутствуют, однако общее число изготовленных винтовок «Арисака»всех модификаций оценивается в десять миллионов штук.